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Adenovirus R-GENE®

Détection et quantification du génome des Adénovirus par PCR en temps réel

  • Réactifs prêts à l’emploi avec contrôles inclus
  • Validé CE-IVD sur différents types d’échantillons et sur les plateformes d’extraction et systèmes de PCR* en temps réel les plus fréquents.
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Application Clinique
Février 2019

Adenovirus R-GENE®

La trousse ADENOVIRUS R-GENE® permet de mesurer la charge virale des adénovirus par amplification en temps réel après extraction de l'ADN viral. Simple et complète, la trousse ADENOVIRUS R-GENE® s'adapte idéalement à la routine du laboratoire.

De nombreux types de prélèvements et d'automates d'extraction sont validés avec la trousse. Les échantillons extraits  peuvent être amplifiés sur les principales plateformes de PCR en temps réel disponibles dans les laboratoires.

 

Standardisation

Le programme d’amplification commun à la gamme R-GENE® permet l’analyse simultanée des échantillons pour l’ensemble des virus / bactéries suivants :

  • ADENOVIRUS
  • HSV1, HSV2 et VZV avec la trousse HSV1 HSV2 VZV R-GENE® (réf. : 69-004B),
  • CMV avec la trousse CMV R-GENE®(1) (réf. : 69-003B)
  • HHV6 R-GENE® (réf. : 69-006B)
  • BKV avec la trousse BK Virus R-GENE® (réf. : 69-013B)
  • EBV avec la trousse EBV R-GENE® (réf. : 69-002B)
  • PARVOVIRUS B19 avec la trousse R-GENE® (réf. : 69-019B)
  • BORDETELLA avec la trousse R-GENE® (réf. : 69-011B)

Les résultats obtenus sont validés par les différents contrôles de la trousse, y compris un contrôle d'extraction. Ces résultats permettent de diagnostiquer plus précocement les infections disséminées à adénovirus, d'en suivre l'évolution et d'améliorer par conséquent la réactivité thérapeutique.

 

Polyvalence

  • Trousse validée sur de nombreux types de prélèvements
  • Extraction d’acides nucléiques automatisée (par exemple EMAG®)
  • Préparation des réactions PCR manuelle ou automatisée avec ESTREAM®
  • Trousse validée sur les principales plateformes de PCR en temps réel

 

Coffret complet

  • Prémix d'amplification spécifique
  • 4 Standards de quantification / contrôle positif
  • Contrôle d’extraction / d’inhibition (vérifie la lyse, l'extraction et l'inhibition)
  • Contrôle de sensibilité (permet de contrôler les performances de la trousse au cours du temps)
  • Contrôle négatif (eau qualité PCR)

 

Procédure simple

La trousse Adenovirus R-GENE® est simple d'utilisation. Il suffit d'ajouter l'ADN extrait de l’échantillon au prémix d’amplificiation prêt à l’emploi et de commencer la réaction PCR sur la plateforme de PCR en temps réel validée (se référer à la Fiche Technique).

 

(*) : PCR : (Polymerase Chain Reaction - Amplification en Chaîne par Polymérase)

(1) Produits appartenant à la liste B - LNE-GMED

Fabricant : bioMérieux SA.
Ces produits sont destinés aux professionnels de santé

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Février 2019

Adenovirus R-GENE® (69-010B)
Principe du test Détection et Qualification du génome des Adenovirus
Technologie PCR en Temps Réel.
Technique des Sondes d'Hydrolyse 5' Nucléase TaqMan®
Gène cible Gène Hexon
Type d'échantillon Sang Total, Plasma, LCR(1), Prélèvements oculaires, Selles, Biopsies, Prélèvements respiratoires (aspirations et écouvillonnages nasaux, LBA(2))
Limite de détection
(95% de probabilité)
Sang Total = 550 Copies/mL
 
Gamme de quantification dynamique

de 500 Copies/mL à 1,0 x 107 Copies/mL

Contrôles inclus Contrôles d'inhibition et d'extraction, Contrôle de sensibilité, Contrôle négatif, Standards de quantification / Contrôle positif
Délai D’obtention des Résultats 90 minutes (extraction non incluse)
Unités de mesure Copies/mL
Nombre de tests 90 tests
Conservation de la Trousse -15°C/-31°C 
   
Équipements validés

PLATEFORMES D'EXTRACTION AUTOMATISÉE(3)

- NucliSENS® easyMAG® (bioMérieux)
- EMAG
®
MagNA Pure Compact® (Roche Diagnostics)
MagNA Pure LC System® (Roche Diagnostics)
MagNA Pure 96 (Roche Diagnostics)
QIAsymphony Sp (Qiagen)

 

EXTRACTION MANUELLE(3)

- QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen)
- QIAamp DNA Stool Mini Kit (Qiagen)

 

 

PLATEFORMES D'AMPLIFICATION(3)

Life Technologies (ABI7500, ABI7500 Fast & StepOne) LightCycler 1.0 LightCycler 2.0 LightCycler 480 II SmartCycler 2.0 RotorGENE VERSANT kPCR Molecular System AD Biorad DX Real-Time system StrataGENE / Agilent - See more at: http://www.biomerieux.co.uk/product/adenovirus-r-GENEr#sthash.oUpuNKHt.dpuf

- ABI7500, ABI7500 Fast, ABI7500 Fast Dx, StepOne & Viia 7
- LightCycler 2.0, LightCycler 480 II
- Rotor-Gene Q
- CFX 96

 

Statut Diagnostic In Vitro, Marquage CE

 

(1) : LCR = Liquide Céphalo-Rachidien

(2) : LBA = Lavage Broncho-Alvéolaire

(3) : Pour plus d'informations, merci de contacter bioMérieux

 

Fabricant : bioMérieux SA.
Ces produits sont destinés aux professionnels de santé

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Février 2019

 

Qu'est-ce qu'un Adenovirus?

Membres de la famille des Adenoviridae, les adénovirus sont des virus à ADN double brin, de taille moyenne et non enveloppés, répartis en 7 espèces (Adénovirus A à G), parmi lesquelles 52 sérotypes ont été décrits.

Les adénovirus peuvent causer des pathologies respiratoires, oculaires ou gastro-intestinales, principalement chez les enfants et les recrues de l'armée, de façon endémique ou épidémique. Les infections à adénovirus sont communes et ont une répartition mondiale.

 

Qui est particulièrement à risque ?

Au cours des dernières années, les adénovirus ont été reconnus comme pathogènes significatifs avec un fort taux de morbidité et de mortalité chez les patients immunodéprimés.
Les manifestations cliniques chez les patients immunodéprimés sont les pneumonies, les hépatites, les cystites hémorragiques, les colites, les pancréatites, les méningoencéphalites ainsi que des maladies disséminées, dépendant, selon la maladie sous-jacente de l'organe affecté, de l'âge du patient et du sérotype d'adénovirus.

 

Quels sont les bénéfices à tester les adénovirus ?

Lorsqu'une infection à adénovirus est suspectée, les échantillons de sang peuvent être testés par PCR, puisque la détection des adénovirus dans le sang est habituellement significative d'une infection disséminée. Le suivi sur sang est une pratique commune parmi les receveurs de greffe de moelle osseuse (HSCT), particulièrement en pédiatrie.

Le virus peut se développer dans le sang 2 à 3 semaines avant l'apparition des symptômes cliniques, ce qui offre une opportunité d'intervention. Le suivi et le pronostic est meilleur avec les méthodes de PCR quantitatives. L'accroissement de la charge virale est associé à l'augmentation du risque de décès.

Les tests de PCR en temps réel pour adénovirus permettent une détection rapide et spécifique avant l'apparition des symptomes et ce afin d'améliorer l'issue pour les patients. Ceci est tout particulièrement important pour les patients immunodéprimés qui peuvent être atteints de manière grave. Ces tests permettent de suivre l'efficacité d'un traitement et surveiller l'apparition de rechute après traitement.

Adenovirus R-GENE®: PUBLICATIONS

  1. Comparison of the EZ1 XL advanced and the Magna Pure instruments for the extraction of whole blood before DNA quantification of CMV, EBV, HHV 6 and Adenovirus
    Marie Gueudin, Alexandre Louvel, Jean-Christophe Plantier, Laboratoire de virologie, CHU de Rouen, Université de Rouen, France. ECV 2013
  2. Comparison of in-house real-time quantitative PCR to the Adenovirus R-Gene kit for determination of adenovirus load in clinical samples.
    Jeulin et al. Laboratory of Virology, Nancy University Hospital, France. J Clin Microbiol. 2010 Sep;48(9):3132-7. Epub 2010 Jul 14.
  3. Adenoviruses in Immunocompromised Hosts
    Echavarria. Laboratory of Clinical Virology, University Hospital, Buenos Aires. Clinical Microbiology Reviews, Oct 2008, 704-715
  4. Analytical and Clinical Evaluation of the Argene Adenovirus R-Gene Assay.
    Malgorzata Kowerska et al. Department of Pathology and Laboratory Medicine, North Shore-LIJ Health System Laboratories, NY. CVS 2011
  5. Prognostic value of qPCR for Adenovirus detection in stool samples compared with antigen detection and cell culture in hematopoietic cell transplant recipients and evaluation of Adenovirus R-gene® kit
    Jeulin et al. Laboratory of Virology, Nancy University Hospital, France. CVS 2010
  6. Outbreak of Adenovirus keratoconjuntivitis in health care workers : coinfection with different Adenovirus species.
    Echavarria et al. Laboratory of Clinical Virology, University Hospital, Buenos Aires. CVS 2009
  7. Development of a new diagnostic tool for the quantification of Adenoviruses by Real Time PCR.
    Magro et al. ARGENE. ESCV 2010
  8. A commercial Real Time PCR for Adenovirus
    Echavarria et al. Laboratory of Clinical Virology, University Hospital, Buenos Aires. ESCV 2009
  9. Validation of commercial (ARGENE) FLU A/B, RSV A/B and Adenovirus PCR assay.
    Hocker et al. Scott&White Hospital/Texas A&M Health Science Center College of Medicine, Temple, Texas, USA. CVS 2009
  10. Detection of Adenovirus DNA from Clinical specimens using commercial Real Time PCR reagents.
    Zheng et al. Children's Memorial Hospital, Northwestern University, Chicago, Illinois.
  11. Real-time PCR for the detection of respiratory viruses.
    Seffar et al. Molecular Diagnostic Center, Laboratory of Virology, Erasme Hospital, Brussel, Belgium. ESCV 2009
  12. H.JEULIN, A.SALMON, P.BORDIGONI and V.VENARD
    Comparaison of In-house Real-Time Quantitative PCR to the Adenovirus R-Gene Kit for Determination of Adenovirus Load in Clinical Samples
    Journal of Clinical Microbiology, Sept.2010.p.3132-3137
  13. TATE JE, BUNNING ML, LOTT L, LU X, SU J, METZGAR D., BROSCH L., PANOZZO CA, MARCONI VC, FAIX DJ, PRILL M, JOHNSON B, ERDMAN DD, FONSECA V, ANDERSON LJ, WIDDOWSON MA
    Outbreak of Severe Respiratory Disease Associated with Emergent Human Adenovirus Serotype 14 at a US Air Force training Facility in 2007.
    J Infect Dis. 15;199(10):1419-1426, May 2009
  14. ECHAVARRIA M.
    Adenoviruses in immuno compromised Host. Clinical Microbiology reviews, Oct 2008, p.704-715.
  15. VABRET A., GOUARIN S., JOANNES M., BARRANGER C., PETITJEAN J., CORBET S., BROUARD J., DUHAMEL JF., GUILLOIS B. AND FREYMUTH F.
    Development of a PCR and hybridization-based assay (PCR ADENOVIRUS CONSENSUS) for the detection and the species identification of adenoviruses in repiratory specimens.
    J.Clin virology 31(2):116-22, Oct 2004.
  16. HEIM A., EBNET C., HARSTE G., PRING-AKERBLON P.
    Rapid and Quantitative Detection of Human Adenovirus DNA by Real-Time PCR.
    Journal of Medical Virology 70: 228-239, 2003.

 

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